Можно и пассатижами, если руки заточены под пассатижи
Можно и пинцетом, если им удобнее. Можно и просто пальцами. У большинства семян после несколькикратного смачивания до размягчения оболочки подойдёт любой удобный вариант.
Если росток невысокий, можно просто засыпать земелькой и подождать пока освободится от кожуры сам, иногда срабатывает.
Бывают случаи, когда ничего не помогает, кожура не размягчается и тогда не обойтись без хирургической операции с иголками, лезвиями, лупами... Всё зависит от конкретного семечка, от его размера, толщины кожуры, возраста, степени высушенности, силы в ростке и т.д.
Самый поганый вариант - когда из семечка вместо корешка вылезает башка. Такой дефект обычно остаётся незамеченным, т.к. неразвивающийся корешок в семечке скрыт от глаз в глубинах грунта. Очень редко, но случается, и такой обычно не жилец.